為減輕公共工程對生態環境造成的負面影響，秉生態保育、公民參與及資訊公開之原則，工程會於106年4月25日訂定「公共工程生態檢核機制」，並列為施工查核項目，而經濟部、農委會等各工程主管機關一年多來已陸續訂定相關作為並落實執行，以利建設之推動，可兼顧工程品質與生態永續。
其中為達成「公民參與」及「資訊公開」的要求，
水利署「全國水
環境改善計畫」即要求各縣市政府應妥予說明整體計畫推動方向及內容，並邀請社區民眾及NGO團體等共同參與，整合收集各單位意見，並將水環境計畫內容及民眾參與情形皆公開於網站。
在「生態保育」方面，
第十河川局並於107年度辦理相關工程生態檢核，為後續業務推展需要，107年12月4日於
第十河川局「
基隆河三貂嶺河段基礎加固工程」工區及「猴硐生態教育園區」，邀請生態專家及治理工程業務相關人員，現場進行生態檢核教育訓練包括生態導覽及實作演練，讓參加學員對於生態檢核做法有進一步的認識，對於辦理工程時在生態友善方面的考量，頗有助益；亦了解到除了生態專業團隊的參與，在地居民與民眾的自覺，常保觀關懷生態的心，協力整理及守護環境，並引進地方文化創意的重要性，以期達到人文與自然和諧發展。