曾文水庫於民國56年動工興建，民國62年開始蓄水營運，為台灣南部地區最主要水資源設施，營運至民國101年底庫容為47,955萬立方公尺，共淤積26,886萬立方公尺，而民國98年8月莫拉克颱風為曾文水庫帶來9,108萬立方公尺淤積量，若持續淤積將嚴重影響南部地區農業、民生、工業與環保用水。
水利署南區水資源局積極辦理推動
水庫清淤之工作，期透過清淤方式以減緩
曾文水庫之淤積，清淤工作雖受限
水庫水位影響，施挖環境不易掌控，及近來土石市場價格低落、
水庫集水區位處山區，土石運輸成本很高等因素影響，惟該局目前仍克服困難降低運輸對環境之影響持續積極辦理。
全力配合經濟部「河川野溪及水庫疏濬後續計畫」(期程自102年9月至103年8月)之清淤目標，其中河道疏通50萬立方公尺、防砂壩清淤5萬立方公尺、曾文水庫蓄水範圍清淤10萬立方公尺、庫區抽泥清淤47萬立方公尺，合計年清淤目標量為112萬立方公尺，而截至103年3月底為止，已完成清淤124.77萬立方公尺，提前達成清淤目標。
在執行清淤時，土方暫置場或去處，為決定清淤進度重要因素，因此亟須地方政府配合協助尋覓土方去處，基此，臺南市政府與該局自100年起成立「大台南地區水庫多元化清淤研商平台」，共同研商提供清淤土方為該府辦理各項公共工程之回填料源，以加速清淤土方去化，目前於103年度已透過該平台協商機制，由臺南市政府協助土方去化7.7萬立方公尺，提供公共工程使用，達成需土方節省公帑、加速水庫清淤之互惠共利。