在成立淡水河流域專責管理單位前，為辦理淡水河流域水文資料蒐集分析工作並提供流域內防汛作業機關應變參考，特設立淡水河流域水情中心，利用傳訊科技收集之水文氣象即時資料，進行展示、分析與研判，以提供相關單位研擬防洪操作方案，據以下達防洪操作決策，以建立整體防洪目標，提高各項防洪設施功能，並提供社會大眾即時水情訊息。
水情資料背景處理系統整體運作架構
水情中心之作業系統係透過數據網路或微波等通訊方式接收中央氣象局、北區水資源局(石門水庫)、臺北市政府(含翡翠水庫)及新北市政府等相關機關之水文資料、颱風動態資料經整理及分析後展示於水情中心，並提供流域內相關防汛機關作業參考。水情中心平時負責彙整各機關相關資訊，以供流域基礎研究之用；汛期時則將流域內各河川水位狀況、集水區降雨分布情形提供防救災單位做為防汛作業參考，並經由網際網路提供社會大眾即時防洪訊息，任務重大。
為確保水情中心能於遭遇各種突發狀況時仍能正常運作，爰建立多項設備緊急應變機制，說明如下：
1.與水利署聯繫中斷-以衛星電話或行動電話替代。
2.與臺北市水利處、石門或翡翠水庫管理單位聯繫中斷-以微波傳真、行動電話替代。
3.與員山子分洪管理中心聯繫中斷-以無線電、行動電話替代。
4.跳電或停電-啟動ups不斷電系統或柴油發電機。
5.有線網路中斷-以網路無線分享器切換。
6.機房失火-機房高壓乾粉消防設備啟動。
7.水情中心資料遺失-員山子分洪管理中心資料自動同步備份。