南化水庫於民國82年開始蓄水營運，原容量為1億5,400萬立方公尺，為台灣公共給水單一標的最大的水庫，也是南部地區重要民生用水的來源。民國97年卡玫基颱風及民國98年莫拉克颱風挾帶超高強度及長延時的豪雨，造成台灣南部地區嚴重的災情，同時也帶給南化水庫約3,700萬立方公尺之淤積量，目前水庫有效蓄水量已低於1億立方公尺，換言之，庫容量僅存原設計容量的三分之二，嚴重影響南化水庫的供水能力。
面對氣候變遷、降雨極端化、壩前淤積升高等問題，南區水資源局規劃新建南化水庫防淤隧道，完工後可進行〝蓄清排渾〞操作，以延長南化水庫壽命。該計畫所需總建造成本約為40.5億元，防淤隧道設計流量為1,000立方公尺/秒，年平均期望排砂比為24%，每年平均排砂量為72萬立方公尺，倘以抽泥船清淤成本計算，可計效益每年達3.84億元。完工後進行排淤運轉，可增加水庫防洪能力、降低洪水期水庫原水濁度、補充下游河道及海岸砂源。
南化水庫防淤隧道工程於104年1月14日上午10時舉行工程開工動土典禮，祈求工程施工順利、人員平安。動土典禮由計畫主辦機關台灣自來水股份有限公司南區工程處及南區水資源局共同舉辦，台灣自來水股份有限公司副總陳昭仁及水利署曹總工程司華平(現升任水利署副署長)代表主辦單位上級機關應邀出席，應邀到場參加動土的貴賓包括計畫所在區域台南市議會議長李全教、台南市政府水利局主任秘書蔡國銓、台南地方法院檢察署主任檢查官陳建弘、自來水南工處處長劉維民、第六區管理處經理王明孝、第六河川局局長蔡宗憲等、另台南市調查處副主任邱耀輝、勞動部職安署南區職安中心簡任技正許峰源、南化區公所區長洪正國、玉山里長邱永霖及北寮里長林金蒼及當地民眾共襄盛舉。
.jpg "南化水庫防淤隧道工程開工動土典禮主辦機關南水局局長黃世偉致詞")
水利署總工程司曹華平期許主辦機關及施工團隊能克服技術困難、障礙，掌握進度期程、堅持品質要求、秉持廉能政策、加強勞工安全、建立地方良好互動關係，如期、如質、如度完成計畫既定的目標。南化水庫防淤隧道工程預定於民國107年完工運轉，屆時可望能減緩南部地區缺水風險度，成為永續利用的穩定水資源。
南區水資源局長黃世偉表示，南化水庫防淤隧道工程全長約1,411公尺，主體工程包括進水口段、閘門豎井段、防淤隧道段及出水口段。此工程之特殊性及困難度包括：進水口圍堰及抗渦結構施工(含水下施工作業)、大型閘門製造及安裝、大規模地下洞室開挖等，這些工程受水庫水位與操作、施工場地、地質狀況等限制條件影響，且工期非常緊迫，為一需多方面專業與技術性的工程，因此採統包最有利標之方式發包選商，期望遴選具備實績經驗、信譽良好、財務健全的優質統包團隊，發揮其專業與技術順利完成本工程。
