配合國家整體防疫政策，降低秋行軍蟲對農業造成嚴重傷害，第五河局自108年6月13日總動員巡查轄管河川區域，除動員機關河川駐警全體巡查外並結合防汛志工、在建工程及維護水門廠商完成巡檢編組共同維護河川生態及農業環境防治秋行軍蟲。
此外，第五河川局於河川越堤道路主動張貼告示，並以簡訊提醒申請種植農民注意河川土地，是否有秋行軍蟲蹤跡，且通知各轄鄉鎮公所及村里辦公室廣播請農民注意，在嚴密巡檢下，第五河川局駐警鄭文凱立即於14日下午16時，於朴子溪雙涵堤段河川區域內玉米田，發現疑似秋行軍蟲幼蟲蹤跡，並通報農委會動植物防疫檢疫局，第五河川局後續通知確認為秋行軍蟲，並接手處理後續防治事宜。
第五河川局自6月13日至19日，針對轄區北港溪、朴子溪、八掌溪、急水溪等全流域巡查完畢為止總計巡檢約500處，除1例確認為秋行軍蟲外，所幸並未於河川內再發現其他案例，研判河川生態尚未受秋行軍蟲嚴重擴散影響。
防治秋行軍蟲村里廣播宣導
秋行軍蟲幼蟲檢查