水利署及所屬108年度公務預算截至3月底止歲入歲出執行結果，本(108)年度歲入執行率為55.76%，主要係用水計畫書、
中央管河川區域使用等審查案件申請、
水權履勘及
河川公地勘查費等屬預估性質無法預估正確數，收回以前年度補助各縣市政府繳回之賸餘款、工程圖說及招標文件收入等較預估數少所致；本(108)年度歲出執行率為74.28%，主要係離島地區用水差價補貼金門縣
自來水廠尚未向
水利署請撥款項及連江縣
自來水廠辦理撥款作業中，另部分工程已執行惟廠商尚未辦理請款，致影響計畫預算執行。以前年度歲入執行率為0.66%，係違反水利法案件因行為人無能力、不願繳納或提行政訴訟，尚未繳納罰款所致；以前年度歲出執行率為62.50%，主要係
湖山水庫工程計畫工程履約爭議經費需視法院判決確定金額後始能撥付，部分工程已執行惟廠商尚未辦理請款等，致影響預算執行。