中央政府機關總員額法第8條及中央政府機關員額管理辦法第15條至第20條規定：一、二級機關應每兩年評鑑所屬機關人力之工作狀況及員額總數合理性，以確保機關整體策略、未來業務發展狀況及員額合理配置目的之達成，並作為預算員額調整依據。
爰經濟部訂定107年度辦理所屬行政機關員額評鑑計畫，請各機關依據院長上任時指示，加強落實零基預算，本撙節原則，確實檢視各項支出的必要性，並以「業務、經費、人力」為主軸，朝機關內部工作分析方式進行業務盤點，檢視現有各項業務的必要性與效益性，就業務與員額配置間之合理性進行檢討。
依上開規定，
水利署除由各單位透過表單填列個別業務優先性外，亦應以整體機關角度於自評報告中列出當前8項重點業務，並對於屬低度核心等級項目檢討是否有去任務化空間，研提自評報告並辦理內部單位業務盤點。
水利署為辦理前開作業，特由賴署長擔任召集人、曹副署長擔任副召集人，及各單位主管組成
水利署員額評鑑審議小組；案經人事室舉辦員額評鑑作業說明會、各單位辦理業務盤點及自評，並召開3次會議檢討及審議，於本(107)年1月完成
水利署自評報告並函報經濟部。
自評報告指出，
水利署當前推動的8項重點業務為「因應
氣候變遷，建立風險管理體系」、「資源管理靜態提升至動態」、「防災安全
整備應變工作」、「導入良善基礎建設」、「以
經濟誘因建立水環境資源管理」、「簡政便民」、「網路經濟」及「行政透明」。而未來3年業務質與量方面，「前瞻基礎建設計畫」係當前政府施政重點，其中「水環境建設計畫」目標是透過新思維、新技術、新環境及新產業等策略，大幅降低淹、缺水的風險，並擘劃優質水環境，預計8年共投資約2507.7億元。
又近年來，
氣候變遷所導致旱澇加劇，在面臨更為嚴峻的
乾旱與
水災挑戰下，要兼顧
防洪、水資源及水環境等需求，業務複雜度及急迫性等勢必增加。另透過前開業務、經費及人力配置檢討，
水利署發現業務已超越組織職掌，現有人力不足以達成相應業務量契合度之情形，雖透過四化等簡餘人力調配後，仍普遍呈現人力不足，使得
水利署近4年單位間無大幅人力調整的可能性，在業務日趨擴增的趨勢下，
水利署現有人力將不足以負荷機關執行業務所需的強度，並研提3項具體說明，理性訴求增加員額之合理性。
針對上開發現與建議，
水利署業務質與量，在現有人力維持不變的情形下，未來的人力挑戰將日益艱鉅；惟為如期如質達成行政院交辦之各項工作及民眾殷盼之優質水環境，及蔡總統為使國人免於淹水、缺水之苦及維持生態永續發展等理念，於105年全國水論壇揭示「智慧
水管理，幸福水臺灣」之願景，
水利署將秉持優良、團結、和諧之傳統，戮力執行各項任務。