臺南市北門區錦湖地區地勢低平，平均高程約在海平面2公尺以下，排水路易受潮汐影響，無法重力排水，如未及時配合抽水機排水，常造成淹水致災。水利署為解決錦湖地區淹水情勢，近年協助臺南市政府辦理相關治水防護工程，陸續完成主要聚落舊渡子頭、北馬、雙春、新圍、大小白米等社區村落圍堤防護及設置抽水站，有效降低淹水風險。
水利署表示，以往每逢颱風豪雨，錦湖地區之錦湖、雙春、新圍等人口密集聚落經常淹水，水利署長期需協助臺南市政府調度移動式抽水機支援排洪。經有系統整治後，位於臺南市北門區地勢最低之錦湖國小，於今(109)年0522豪大雨考驗，校園並未產生積淹水情形，治水功效深受各界及地方之肯定。
水利署說明，為改善錦湖地區淹水問題，於103年起「流域綜合治理計畫」及「前瞻基礎建設計畫」，水利署持續投資約3億餘元協助臺南市政府進行治理，已大幅改善當地淹水困擾。未來仍將持續協助地方加速改善水患，保護居民生命財產安全，提供安居樂業的環境。