109年度水資源作業基金附屬單位預算業務收入編列82億4,108萬7,000元，業務外收入編列2億3,493萬3,000元，收入合計編列84億7,602萬元。
109年度水資源作業基金附屬單位預算業務成本與費用編列92億5,687萬2,000元，業務外費用編列2億5,502萬5,000元，成本與費用合計編列95億1,189萬7,000元。
109年度水資源作業基金附屬單位預算固定資產建設改良擴充編列11億443萬4,000元。
109年度水資源作業基金附屬單位預算案，立法院尚在審議中，目前未完成法定程序，各科目預算數請參閱附加檔案。