水利署109年度行政院暨經濟部列管公共建設計畫合計有24個，年度結束實際進度符合預定進度者有18個計畫；而進度落後者有6個計畫，分別為蓄水建造物更新及改善計畫(第3期)、台南山上淨水場供水系統改善工程計畫(前瞻)、桃園-新竹備援管線工程計畫(前瞻)、推廣水資源智慧管理系統及節水技術計畫(前瞻)、防災及備援水井建置計畫(前瞻)及離島地區供水改善計畫第二期(前瞻)，其落後主因係以行政、估驗及核銷作業未及、變更施工方式及工程發包問題等因素導致進度落後；其中進度落後最多者為蓄水建造物更新及改善計畫(第3期)工程，因發包施工採跨年度預算方式辦理，已完成部分未能適時於年底完成估驗及核銷作業，致進度落後達2.0個百分點。