經濟部於民國94年研提易淹水地區水患治理計畫後，以分年分期經費辦理該計畫，當時水利署第五河川局轄區內雲林縣及嘉義縣地區因人員一時無法因應計畫中如此多之工程，故由其他河川局派員支援，第一河川局自民國96年起支援九件工程，總工程經費約十億，至目前已全數完工，最後一件完工工程為位於嘉義縣朴子市的「荷苞嶼排水系統-下竹圍中排二及故宮排水路改善工程」，該工程完成後對嘉義縣朴子市市民及故宮南院實為一大福音。
下竹圍中排二及故宮排水路改善工程係分為二工區，分別為位於嘉義縣朴子市的下竹圍中排二及位於故宮南院北側的故宮排水路。嘉義縣朴子市以往淹水原因可以歸納為三大類：
1.第一類為外水倒灌因素，當上游逕流集中至荷苞嶼大排時，若遇到朴子溪水位上漲，使得荷苞嶼大排以及上游各支線發生外水溢堤，將造成集水區內各地區嚴重淹水。
2.第二類為內水排除不易因素，當荷苞嶼排水幹線及各支線水位上漲時，使得集水區內各地區之排水系統無法以重力方式排除，區內又無足夠容量之抽水設施，造成內水排除不易而淹水。
3.第三類為降雨因素，當降雨過度集中，或總累積降雨量過大，使得區內排水系統容量無法負荷，造成淹水。
荷苞嶼整體排水系統流量之設計以95年5月3日核定之「易淹水地區水患治理計畫（修正計畫）」內容為依據，其工程設計標準為：縣（市）管區域排水以10年重現期洪水設計，25年重現期不溢堤為目標。同時整治之工程與非工程手段皆應考慮地區發展策略，且以對於環境與生態衝擊最小為標的。
本工程考量荷苞嶼排水系統現有防洪設施、區域現況與未來發展情勢、及現有內水排水設施等因素，整體荷苞嶼排水系統暴雨洪水之導排，係依高、低區位之不同分別排除，高地區位洪水以重力排除為主，低地區位內水因受限於主流水位頂托影響，較不易排入，因此以蓄洪配合機械抽排為主辦理改善，下竹圍中排二完工後可解決朴子市區淹水問題，改善淹水面積約30公頃。
另外故宮南院目前正施工中，本工程另一工區故宮排水路工程係位於故宮南院北側，本區段原來渠道內雜草叢生，且河道束縮相當嚴重，洪水來臨無法發揮防潮功能，故辦理改善，本區段長度約130公尺，主要為匯集故宮西側放水路的排水後，往北排入朴子溪中，故宮排水路改善工程的完成將有效減少附近地區淹水現象，改善淹水面積約10公頃。