莫拉克颱風災後集水區內崩塌土石流入河川、野溪及水庫，政府透過中央各部、會及縣、市政府通力合作下，已完成約2.5億立方公尺淤積土石之清除。中央管河川上游河段因位屬深山，施設河床運輸便道，施作成本及難度過大，執行疏濬困難，且成效有限，故仍以瓶頸段、具保全對象河段辦理疏通為原則。然中央管河川上游集水區內仍有土石位於山坡地上，崩塌土石可能再隨颱風豪雨沖刷而下造成下游河道淤積，然需透過政府持續辦理改善及疏濬工程以減少河道淤積量。為讓民眾、NGO團體或地方意見領袖瞭解水利署辦理疏濬工作之成果並聽取民眾意見，水利署針對莫拉克颱風致災嚴重地區辦理一系列之公民座談會，藉由民眾參與討論，作為後續河川治理及辦理疏濬工作之參考。
水利署今（103）年預計辦理濁水溪、曾文溪、高屏溪溪及八掌溪等計4場地方公民座談會，現階段已完成濁水溪及曾文溪等2場地方公民座談會，後續仍持續推動辦理，透過互動意見交流，可讓民眾充分發表意見，廣泛收集各方建言，並了解當地民眾改善需求。
水利署於6月12日假南投水里鄉公所辦理濁水溪流域地方公民座談會，民眾主要反應河川疏濬之有價土方運出變現金後，留下的地方環境及空氣污染問題由地方人民來承受，疏濬工程之公益支出是否能優先辦理沿岸生活環境之改善；另9月3日於嘉義阿里山鄉公所辦理之曾文溪流域地方公民座談會，民眾表示當地疏濬工程或相關治理工程推動前，應辦理公民座談會或公聽會，進行充分溝通後再進行工程施作，較能有效了解在地民眾需求。另有關上游土砂治理涉及不同部會權責部分，應由不同部會共同會勘及討論後，實質分工辦理，儘量避免各自為政，影響工程施作成果及民眾觀感。
民眾對於水利署推動地方公民座談會深表滿意，未來水利署將持續辦理後續公民座談會，透過良好的公民參與，除了瞭解傾聽民眾聲音外，更要能確實接受民眾意見並配合落實，如此獲得在地民眾認同感有助於疏濬或工程推動，以通暢水流、減少溢淹、維持河道輸砂平衡、河道穩定及減少災害發生。