為解決大台南地區歷年淹水問題，水利署第六河川局多年來大力推動曾文溪排水治理工程，以達成曾文溪排水整體治理保護標準，為解決曾文溪排水沿岸長年淹水之苦，自民國98年起逐年籌編經費從下游往上游辦理工程用地取得以及整治工程，沿岸雖歷經棘手之數十年未辦理分割繼承土地，及非法佔用之建築物，造成徵收之困難，該局排除萬難逐案克服，迄今終已完成徵收至潮見橋段，全長約3公里。用地完成徵收後該局亦逐年編工程整治經費，迄今年底已將完成徵收之區段陸續完成護岸之整治。對曾文溪排水沿岸居民生命財產之安全大為提高。
除已完成上述整治工程外，並仍持續逐年往曾文溪排水中上游河段辦理，目前正推動曾文溪排水潮見橋上游段護岸新建工程(一工區)，該河段現況尚未整治，河道斷面不足，影響通洪。為疏導水流及增加通洪斷面，以避免汛期間該河段溪水溢堤，該局於民國103年已辦理完成工程用地取得協議會議，後續於完成工程用地取得後，將進行整治工程，以舒緩當地淹水問題。