環境影響評估顧名思義，即在事前防範開發對環境造成之不良影響，藉以達成環境保護之目的。由事前預防或減輕開發行為對環境可能造成之影響，也由事後追蹤監督開發行為執行情形，並依法採取必要之處置。因此每年追蹤開發行為進行中及完成後使用時環境之動態，並檢核開發範圍環境是否確實符合保護環境及永續發展之現況，亦為政府施政、檢討之重要依據 。
近二十年來，水利署興辦重要水利工程案件中，計有「寶山第二水庫工程計畫」、「中庄調整池工程計畫」、「集集共同引水計畫」、「湖山水庫工程計畫」、「鯉魚潭水庫計畫」、「阿公店水庫更新改善計畫」、「曾文水庫越域引水工程計畫」、「南化水庫越域引水工程」、「大里溪治理計畫先期規劃」、「基隆河員山子分洪工程計畫」、「吉洋人工湖可行性規劃」、「曾文水庫越域引水下游輸水工程計畫」及「烏溪鳥嘴潭人工湖工程計畫」等13件工程，經由環境影響評估法之審查通過後執行。該13件工程概屬重大水資源開發工程，從規劃設計、進行及完成後使用，均將環境保護納入考量，以落實預防及減輕其對環境可能的不良影響，達到環境保護的目的。
依據環境影響評估法第18條開發行為進行中及完成後使用時，應由目的事業主管機關追蹤，及同法施行細則第39條開發單位執行環境影響說明書或評估書內容及主管機關審查結論事項之規定。因此水利署訂定「經濟部水利工程環境影響評估追蹤考核計畫」並代經濟部每年度辦理追蹤查核該13件通過環境影響評估及審查結論、承諾事項實施情形，以落實環境影響評估工作。
依據上開追蹤考核計畫，並成立追蹤考核小組辦理追蹤查核工作，追蹤考核小組委員由水利署聘請約五位專家學者及水利署相關組室主管組成。追蹤查核工作包括書面審查與現地追蹤考核兩項。書面審查部分由開發單位填報追蹤事項執行情形報由水利署審查，並擇選北、中、南地區進行中或營運中之工程辦理查核。
本(103)年度現地環評追蹤考核作業，水利署於103年10月下旬啟動，擇選進行中「湖山水庫工程計畫」、「中庄調整池工程」及營運中之「基隆河員山子分洪工程計畫」辦理現場追蹤考核，本年度邀請包括台灣大學蔣本基教授、中興大學游繁結教授、林信輝教授、中央大學吳瑞賢教授、東海大學張鎮南教授等至現地考核。預計103年11月上旬完成追蹤考核工作，考核成果及書面審查資料彙整後，預定於103年12月底前提送環保署備查。
水利署執行環評追蹤考核制度迄今已多年，在水利署北、中、南水資源局及相關河川局及環保機關共同努力下，確實發揮預防及減輕開發行為對環境之不良影響。其中進行中之「湖山水庫工程計畫」環境保護及生態保育成果顯著，已獲認同為生態保育之典範工程。因此，未來水利署除落實追蹤考核及改善作為，以實踐環境影響評估報告書中之承諾，符合社會的期待外，並將環境保育工作努力於各項水利工程中，落實預防環境污染、確保開發環境品質，追求永續發展之目標。