國有土地，範圍遼闊，面積龐大，分佈零散且性質各異，管理上極為困難，因而容易發生遭非法占用之情形。國有土地被占用，已嚴重侵害到國產權益，且對整個社會及享有土地主權的國民全體，造成不公。依據國有財產法第4條第1項規定，國有財產可區分為公用財產與非公用財產兩類，同法第2項規定，公務用、公共用及事業用等財產稱為公用財產，而非公用財產，係指公用財產以外可供收益或處分之一切國有財產。
又同法第11、12條規定，前述非公用財產以財政部國有財產署為管理機關，承財政部之命，直接管理之；而公用財產則以各直接使用機關為管理機關，直接管理之。
被占用之國有公用不動產，財政部訂有「各機關經管國有公用被占用不動產處理原則」處理占用問題，98年間考量各機關處理經管之被占用國有公用不動產之案情複雜、無專責人力等因素，為增加占用人自願騰空返還土地之誘因，乃檢討修正上開規定，增訂占用人於管理機關提出訴訟請求排除占用前，配合依限騰空返還者，得免收使用補償金，已進入訴訟程序，於一審判決前，占用人自行騰空返還者，得減收使用補償金之機制，執行迄今，已見成效，顯見該項規定對於各機關解決占用問題及加速收回土地，確有正面助益。
水利署轄管，目前由各河川局代管之公共用土地，經查亦有遭占用之情形，水利署於102年11月14日土地管理檢討會議中決議水利署轄管土地，位於河川區域外，範圍明確、無使用需求且無被占用者，優先辦理變更為非公用財產移交財政部國有財產署接管。
第八河川局依循規定，針對無公務使用需求且未遭占用，或於土地完成占用排除後，將其變更為非公用財產交國產署接管；另部分遭占用土地，因符合國產署放租條件，即於收取使用補償金後，採現況移交方式交國產署接管。
各機關管理公用不動產，因管理人力不足，土地遭占用情形仍持續增加，為預防並加速處理被占用情形，除派員加強巡查及避免土地閒置外，仍期待財政部等相關單位持續檢討占用處理機制，以提高土地管理效能。