水利署為順利取得各項水利工程
河川及區域
排水公有土地，其地上改良物如涉及救濟，考量使用人耕作及投資成本，並獎勵其配合施工，依「協商原則」核發公有土地地上物救濟金，已行之有年。但上述「協商原則」實施以來，監察院及經濟部均多次請
水利署檢討發給公有地占用人救濟金之妥適性，且各縣市政府規定的救濟標準也有所差異，有違平等原則。
目前
水利署工程之執行，已建立先行取得用地再施作工程之制度，配合土地徵收條例修正，用地取得作業已更為周延，故於103年訂定落日條款，停止適用「
經濟部水利署興辦水利工程使用
河川及區域
排水公有土地救濟方案協商原則」。
「協商原則」停止適用後，對於
河川及區域
排水範圍內使用公有土地如仍有需救濟之情形，採因地制宜方式回歸直轄市、縣市政府相關規定辦理。至於正在辦理之用地取得、或已承諾依上述「協商原則」辦理救濟等過渡時期案件，基於信賴保護原則，仍予適用，以保障民眾權益不受影響。