旗山溪新旗尾橋下游左岸末端因地勢平坦、防洪高度不足，第七河川分署於111年辦理「旗山溪旗尾堤段改善工程」(以下簡稱本工程)，以100年計畫洪水位作為保護標準，採用河道疏濬所生在地土石材料構築堤身及高灘，往下游築堤383.3公尺銜接至美濃溪堤防，完成旗山溪旗尾堤防最後一哩路。
本工程設計階段即委託生態環境保育專業單位協助辦理生態保育作業，確認生態保全對象、生態關注區域完好，研擬生態保育策略，包含：減輕（減少擾動、植樹、多孔隙緩坡、側溝避免全面封底）及補償（營造野塘於取土區）等，設計人員將該生態保育策略納入設計，生態環境保育專業單位並於施工階段與施工人員進行生態教育訓練，持續協助檢核施工過程現場執行情形，以利落實原擬定之生態保育策略。
本工程已於113年1月完工，新設堤防除提升河防安全外，可藉此營造濱溪生態林及生態廊道，更串聯旗山溪與美濃溪堤防之水防道路網絡，有助未來河川巡防。