為維護改善河川水體水質，並提供各界瞭解週遭水體環境現況，行政院環境保護署在重要河川皆定期進行水質監測，就懸浮固體、生化需氧量、水中溶氧量及氨氮等4項檢測結果依理化積分法估算污染長度。依據環保署109年統計，25條重要河川共2,257.8公里長度中，其中未(稍)受污染為1,532.4公里占67.9%，輕度污染219.3公里占9.7%，中度污染438.2公里占19.4%，嚴重污染68.0公里則占3.0%。若與上年比較，未(稍)受污染比率下降1.2個百分點，嚴重污染比率增加0.5個百分點，顯示109年重要河川污染程度較上年污染程度嚴重。