近年來生態保育意識提升，民眾開始關注疏濬工程與生態環境的影響，為此，第一河川分署(以下簡稱一河分署)自民國108年辦理蘭陽溪口疏濬工程，即主動提出辦理生態檢核，在工程同時涉及「蘭陽溪口國家級重要濕地」、「宜蘭縣蘭陽溪口野生動物重要棲息環境」、「蘭陽溪口水鳥保護區」、「臺灣重要野鳥棲地」多個生態敏感區域的嚴峻條件下，同時營造鳥類棲地的方式達到生態共榮，獲得生態保育團體的認同。秉持降低工程對生態的負面影響之責，一河分署持續辦理疏濬工程生態檢核，期望透過案例累積，更深入瞭解疏濬對生態會造成哪些影響，在生態面相上追求工程之不斷精進。
113年一河分署辦理「和平溪12~19斷面間河段疏濬工程」生態檢核，邀請宜蘭在地長期觀察溪流生態的人禾環境倫理發展基金會－方韻如顧問、宜蘭荒野保護協會河溪小組，分享她們對疏濬工程的觀察。她們提到:「越靠近出海口的河川支流，對洄游性生物來說越重要」，針對疏濬也提出幾點看法，包含疏濬時順接主支流銜接處高程、完工撤場時移除施工便道等，就能讓洄游魚類順利上溯；在自然流路上保留大石，幫助魚類庇護棲地－深水潭的形成；針對紫芋蘭、芫花、列當等稀有植物進行保護等。
透過工程與生態專業人員雙方深度交流溝通討論，發現在不增加額外工程成本條件下，有許多方式能夠協助生態回復。一河分署內化吸收這些觀念，將上述生態考量納入本次和平溪的工程設計，期望在未來的疏濬工程持續應用、持續精進，持續推進疏濬與生態之間的平衡。