鹽水溪經歷次颱風豪雨影響，將上游山溝野溪淤積土石帶至河道中，造成鹽水溪下游河道土石大量淤積，歷年來第六河川局積極辦理疏濬工程：太平橋至永安橋(95年)、斷面61至66-1(98年)、開運橋(斷面49)至斷面58(99年)、「水橋(斷面36-1)至水管橋(斷面42-1) (101年)、高鐵橋上下游200公尺(102年)及大洲排水出口至過水橋(斷面32至36-1)(103年)等，惟因政府近年來籌措財源不易等因素下，在疏濬作業發包前，為減緩汛期間造成台南市關廟、永康及新化區等地淹水情勢，第六河川局遂於103年於維護作業中，趕辦新仁橋上游高莖作物剷除及新灣橋上下游深槽流入河道整理。
鹽水溪新仁橋上游右岸高莖作物剷除及河道整理，係因鹽水溪新仁橋上游，多為竹子等高莖作物，每逢豪雨，新仁橋便因高莖作物堵塞河道，造成當地淹水等情勢。其後於103年度汛期前，趕辦本河段高莖作物剷除及深槽流入河道整理等作業，有效地增加通洪斷面，深受地方肯定。
另有關鹽水溪新灣橋上下游河道整理之工作，本段原於99年度辦理疏濬作業在案，惟歷經4年多豪雨，其河道已明顯淤積，在疏濬作業前，遂分別先將新灣橋上游及下游，以河道整理的方式增加其深槽流入通洪斷面，以期能減緩當地淹水情勢。
