水利署辦理工程，近年來由於持續重視工程品質的提升及各所屬機關努力結果，103年全年度工程受查核成績甲等共有50件，占所有受查核工程的82%，為歷年來最佳成績，繼102年甲等占78%後，再創新高，顯見水利署全力提升工程品質之作為，達到預期成果。
水利署接受工程施工查核係由行政院公共工程委員會及經濟部辦理，查核成績80分以上為甲等，70分以上未達80分為乙等，60分以上未達70分為丙等，103年水利署全年度受查核工程共61件，其中甲等為50件，乙等為11件，無評列丙等之工程，平均查核成績為80.6分。
工程查核由工程會及經濟部邀請專家學者組成查核小組，針對工程主辦機關、監造單位及施工廠商的品管制度與執行、施工品質、材料檢驗、勞工安全及環境保護措施與施工進度等各項因子作綜合評分，並將查核缺失事項作成查核紀錄，以公文通知受查核機關，受查核機關應在規定期限內(原則上為1個月)，將改善結果及預防矯正措施函送查核機關備查。工程查核為工程會建立之一套完整的查核機制，已行之有年，對於國內公共工程施工品質的提升，有莫大的助益。
在所有經濟部的機關，水利署工程查核甲等比例排名第3，尚落後台灣電力公司(90.6%)及台灣自來水公司(85.3%)，顯見仍有再努力的空間，但相信經由水利署及所屬機關全體同仁持續努力，必能再提升國內水利工程的施工品質，確保水資源利用及維護防洪工程安全。