石門水庫蓄水範圍於民國80年7月11日經前臺灣省政府依據「臺灣省水庫蓄水範圍使用管理辦法」公告，另於民國90年1月29日及96年9月7日公告修正石門水庫蓄水範圍及蓄水範圍內禁止事項，其蓄水範圍係指水庫設計最高洪水位標高250公尺與其迴水所及蓄水域及後池、後池堰至下游1,500公尺之河川區域，其範圍之行政轄區屬桃園市龍潭區、大溪區、復興區及新竹縣關西鎮，面積總計約1,009公頃。
於民國60、70年代觀光業興盛，水庫周邊旅館餐飲及水上遊樂設施等事業欣欣向榮，水域內船隻盛況空前，相對也有影響水質、水量及水土保持之虞；因近年來國人更加重視生態保育環境議題，爰為維持航行於石門水庫水域內之各類船筏之安全及秩序，依據「水庫蓄水範圍使用管理辦法」、「石門水庫捕撈孳生魚類及水產物許可管理要點」、「石門水庫蓄水範圍船筏航行許可及管理要點」規定，以總量管制水庫航行船隻數量，限定漁撈船筏72艘、農務船筏65艘及民有遊艇45艘。
另為維持水域秩序及有效防杜水域違規事件之發生，依據「水利法」、「水庫蓄水範圍使用管理辦法」及「石門水庫蓄水範圍違規事件處理程序表」規定，北區水資源局（以下簡稱北水局）與內政部警政署保安警察第七總隊第二大隊第一中隊（以下簡稱一中隊）負起蓄水範圍水域巡查工作，並依違規內容通報轄管之各地方政府依相關法令規定裁處，以維水庫水質水量、生態環境及水利設施安全。自艾利颱風過後，為加強上游地區國有林地內之枯倒木管制，行政院農業委員會林務局新竹林區管理處與北水局及一中隊有良好配合機制，於汛期間實施共同水域巡查，以防止漂流木流至庫區遭莠民覬覦。
石門水庫部分水域開放申請使用，需辦理活動者，可依據「石門水庫水域水面使用許可及管理要點」規定向北水局申請許可。另為協助推動國家體育活動發展，目前有桃園市體育會划船委員會及桃園市大溪高中輕艇隊依前揭要點規定，申請使用三民溪水域及龍珠灣水域，做為划船選手訓練之場地。代表桃園市參加全國各項划船錦標賽及代表國家參加奧、亞運等國際賽事，曾獲得「2012年倫敦奧運亞洲資格賽選拔賽」女、男子雙人雙槳第一、二名、「102年秋、冬季全國室內划船錦標賽」女子組第一名、「102年亞洲錦標賽」輕艇水球男子組第一名、「101年全民運動會」輕艇水球女子組第一名等殊榮，競賽成績表現相當優越。