工程用地取得涉及都市計畫個案變更時，作業時程需增加至少一年半作業時間，嗣都市計畫變更完成後，才得再接續辦理用地取得；惟近年本署所屬機關偶因重要工程需要趕辦，致工程發包時仍未完成上開程序，造成工程妨礙都市計畫疑慮。
依土地管理組近年協助河川局執行工程用地取得經驗，無論是都市計畫個案變更或者接續之工程用地徵收程序，因涉民眾權益且屬主管機關內政部審查權責，因審查機關對各階段的程序完備與否極為重視，倘有民眾陳情、異議或程序不完備情形，均會影響審查進度；另都市計畫個案變更結果亦影響後續工程用地分割程序，故個案變更與用地徵收兩程序並無法併行辦理。
至於水利署各所屬機關辦理重要工程時所採的趕辦模式及經驗，是否能引為工程用地取得作業參考呢?經探討結果，因辦理工程案件時水利署各所屬機關係擔任甲方具主導性，故可透過向廠商邀標、增加工班或工作面等方式來加快工程案辦理進度；而辦理工程用地取得相關程序時，水利署各所屬機關係需地機關身份轉變為被審查者，必須配合權責機關之規定與所安排期程辦理，故壓縮期程之可能性極低。
因此，工程用地取得倘涉及都市計畫個案變更時，仍請各所屬機關執行類似案件，應寬估期程並提早作業才是正規的辦理方式，以避免影響整體計畫推動期程。