莫拉克颱風後為了維護河防安全，行政院98年核定「加強河川野溪及水庫疏濬方案」，在中央與地方政府通力合作，及國軍積極協助執行下，自災後至101年8月底止，已完成2億5,712萬立方公尺的土石量，達成率為161.85％。
前述方案結束後，本於疏濬無間斷，滾動檢討河床淤積情形，爰賡續推動「河川野溪及水庫疏濬後續計畫」(101年9月~102年8月)，水利署各河川局把握枯水季黃金時段，已提早於去年(101)年11月底，全面展開各疏濬工程發包，透過增加工作面、延長工時、施設河床運輸便道等方式提高疏濬能量，已提前於今（102）年5月7日完成3,600萬立方公尺計畫目標量，而截至6月16日止，則已執行4,144.7萬立方公尺疏濬量，達成率115.13%。
目前時序已進入汛期，本署除持續無間斷執行疏濬外，並已請相關執行單位針對急要瓶頸河段再加強檢視，俾適時檢討辦理疏濬或疏通，以維河防之安全。