北門
濕地位在
急水溪與將軍溪之間，包括
急水溪出海口、海汕洲南端、王爺港汕及陸上魚塭區以及其所圍成的潟湖、北門鹽灘地，幾乎涵蓋了整個台南市北門區的海岸，
濕地生態豐富而完整。另海岸
堆積作用旺盛，形成潮汐灘地、潟湖、離岸沙洲等，擁有新月丘、鯨背丘等豐富
地形景觀。
北門
濕地之潟湖面積遼闊，有
牡蠣等漁業資源；退潮後，漁民在
急水溪口採集文蛤及赤嘴蛤。還有台灣招潮蟹、清白招潮蟹、北方呼喚招潮蟹、弧邊招潮蟹、粗腿綠眼招潮蟹及三角招潮蟹、窄招潮等7種招潮蟹。
急水溪口的
海茄苳紅樹林區有鷺鷥繁殖。
沙灘與土堤的植物有禾葉
芋蘭、海埔姜，漁塭有苦林盤、濱水菜，鹽田有流蘇菜、鹽萣、蘆葦、
海雀稗及莎草科植物，較珍稀的植物包括
欖李、
海茄苳、苦林盤、
苦檻藍等。北門
濕地有鳥類29科119種，為台灣重要野鳥
棲地。