過去為維持水域周邊聚落建設、經濟活動及民眾生命財產安全等，以築堤
束洪、疏濬或
綜合治水方式加上非工程措施，以減免
颱風豪雨期間災害之發生。近年生態環境保育意識抬頭，除了須維持滿足
防洪安全外，
水利署更將生態保育構想納入規劃設計，防止造成環境資源發展失衡的情形，並善加珍惜與保護，以落實國土保育及永續家園的理念。
因此
水利署近年來推動重要
河川及海岸環境營造計畫，以執行
河川、海岸之防災
減災、環境景觀及
棲地營造、
水系基本情勢資料調查監測及技術發展、維護管理等工作，另亦推動
出流管制與
逕流分擔，前述相關措施的實施，兼顧提供生態保育
防洪空間，以期水利建設能達到與生態相互共生之目標。
98年7月22日行政院協調各部會共同推動「國家重要
濕地保育計畫（100-105年）」，而國家重要
濕地保育及復育之推動，是以行政院永續會為協調平台，並分為共同辦理事項及分工辦理事項，共同辦理事項由內政部營建署主辦，分工辦理事項由水利署、農委會、環保署、營建署等單位共同分工辦理，爰100年至105年
水利署補助
濕地保育行動計畫經費共計新臺幣4,756.8萬元。
今(105)年9月13日至14日
水利署與環保署、營建署及林務局共同主辦2016
濕地大會研討會，邀請國內外專家學者及各單位人員參與，以此交流提升水域環境與治水共生構想，並作為
水利署治水策略及
河川、海岸環境營造重要參考。