排水規劃時對於風險控制具相當之重要性。現行排水規劃主要依據95年6月「區域排水整治及環境營造規劃參考手冊」(以下簡稱手冊)，惟目前分析流程，尚未進行適當之風險評估及控制。考量近年來氣候異常之水文事件頻仍，排水設施在規劃策略或條件外預期成效與實際事件發生結果間之差異程度。此差異程度如無法達成預期成效且造成災害擴大或災害轉移之負面影響時，則此規劃策略或條件就存在風險，應進行風險控制。因此，未來排水規劃將朝向於現行手冊新增規劃方案正、負面之考量及風險控制。
手冊風險控制作業可分為兩階段辦理，第一階段為定性分析，規劃者應明瞭排水規劃風險概念，在規劃初始時就需注意方案可能之風險，避免災害擴大或災害轉移之負面影響，故於綜合治水對策研擬時需進行風險辨識。第二階段則為定量分析，在方案擇定時之風險評估或分析。其兩階段風險控制架構如圖1所示，作為日後增修排水規劃流程之參考。
兩階段辦理控制作業之主要內容，分述如下:
(一)第一階段:
排水規劃方案評估時應將所擬方案之單一設施或組合設施進行風險辨識及影響，包括檢視所擬方案對原災害之消減是否有未達預期成果，或是新規劃設施會造成災害擴大或新增災害之負面影響之可能性，作為方案擇取之參據。依據所擬方案確認風險來源進行辨識風險項目。例如新增排水設施而改變地貌、規劃前後保護標準以上水文事件之災害規模及區位辨識、以往災害情形、訪談、排水設施工程順序、區位等。
(二)第二階段:
基於綜合治水對策所提出之排水整治方案，於規劃方案擇定時應對可能方案之單一設施或組合設施所造成之風險進行評估或分析，以量化方式評估方案於洪災消減上，是否會有與預期效果有所差異或造成災害擴大及新增災害之狀況以及其影響程度，以作為方案決策之參據，流程如圖2。