水利署及所屬106年度公務預算歲入歲出執行結果，截至9月底，106年度歲入執行率為94.78%，主要係出售報廢財產收入屬預估性質無法預估正確數及
中央管河川治理工程所餘土石方標售收入較預估數多所致；106年度歲出執行率為88.89%，主要係部分委辦計畫及工程已執行惟廠商尚未辦理請款，致影響進度。
以前年度歲入執行率為0.79%，係因違反水利法案件因行為人無能力、不願繳納或提行政訴訟，尚未繳納罰款所致；以前年度歲出執行率為49%，主要係
湖山水庫工程計畫大
壩工程履約爭議經費需視法院判決確定金額後始能撥付及金門自大陸
引水工程計畫工程已達成合約可請款進度，惟縣政府尚未完成請款作業，致影響預算執行。