新竹每年1-3月為最旱時期，降雨往往為最少，又遇2月春耕搶水，水庫水進出差異過大，水位就直直落，今(108)年2月集水區降雨量更是創史上新低，3月4日起新竹地區水情燈號轉黃燈，寶二水庫也於3月6日17時跌至125.6公尺，蓄水量剩599萬噸（19.02%），創下水庫最低水位紀錄。為因應供水吃緊之情勢，北區水資源局積極採取區域水源調度、人工增雨、抗旱井、農業節水及各項用水管控機制等措施，全力抗旱。
在區域水源調度，由桃園石門水庫與苗栗永和山水庫調度支援最大量達每日16萬噸。抗旱井抽取地下水，在北區水資源局與自來水公司三區處努力下，短期間從原先預定3口井增至6口井，出水量也從每日0.4萬噸增至1萬噸，當時，也遭遇寶二水庫見庫以來，水位最低之一刻，水庫利用重力供水方式，無法滿足需求，北區水資源局第一次啟動水庫下游抽水加壓站，藉由抽水補足不足水量。這段抽水加壓站啟動期間，同仁輪班日夜固守，卯足全力維持設施運轉正常，穩定新竹地區供水。
這時，老天彷彿看到了大家的努力，自3月7日連續下7天雨，讓新竹地區水情在3月14日由一階限水的黃燈轉為綠燈，至4月19日水情燈號更是轉為水情正常藍燈，在這1個半月中累積降雨量更達550毫米，終於4月24日寶二水庫滿水位標高150公尺，水位回升24.4公尺，解除缺水危機。
回顧新竹地區缺水，主要為天候異常降雨偏少，以及庫容不足、淨水場處理能力及區域調度能量均有限。為降低缺水風險，未來評估寶二水庫溢洪道頂加高，以及推動增加石門水庫支援新竹系統水量及擴增新竹水廠淨水池容量等措施，期能增加新竹在地水庫蓄水量及鄰近水源支援量，有效穩定供水，讓新竹在宜居城市更加分。