我國營運中之海水淡化廠截至109年底止共計23座，除屏東縣2座及高雄市1座以外，其餘皆位於離島地區，以供應民生、工業用水需求為主。民國105至109年年平均實際造水量為823.47萬立方公尺，其中以109年907.20萬立方公尺最多，次為108年888.29萬立方公尺。
近5年（105-109）海水淡化廠營運比較
若觀察近五年各縣市海水淡化廠營運狀況，位於澎湖縣之海水淡化廠合計每年實際造水量約占整體八成為最多，其次為連江縣約占整體實際造水量一成，而屏東縣約占2%至3%左右，金門縣除106年因改善工程暫停營運致占比降為0.39%外，105年及107年占比約為1%，108年因大金門海水淡化廠功能暨擴建工程完工營運，實際造水量大幅提升，108年後占比增為4%至5%。
若以個別海水淡化廠營運量觀察，近五年總實際造水量以馬公第一海水淡化廠10,000CMD海水淡化場2,018.05萬立方公尺為最高，馬公第一海水淡化廠3,000CMD海水淡化場614.81萬立方公尺次之，兩者皆位於澎湖縣，澎湖地區四面環海且地勢平坦屬易缺水之環境條件，此項水資源之提供實對當地居民帶來不少助益。