水利規劃試驗所於民國109～110年與行政院農業委員會特有生物中心合作辦理「河川情勢調查及保育措施精進」計畫，盤點歷年河川情勢調查成果，針對河川情勢調查要點面臨之現況問題或不足處進行通盤檢討，並編撰「中央管流域整體改善與調適計畫─生態調查操作指引」及其附冊。
本計畫盤點臺灣生物多樣性網絡(TBN)、臺灣生物多樣性資訊機構(TaiBIF)與 eBird等開放資料集/入口網，通過專家審核產製出150種淡水魚分布地圖，以臺灣䱀與粗首馬口鱲為例（如圖1～2），其中包含紅皮書受脅、極危、瀕危的魚種，可提供各河川局啟動生態專案調查及辦理河川環境情報地圖計畫之生態情報資訊。
臺灣䱀分布圖
粗首馬口鱲分布圖
另水利署於民國110年函頒「經濟部水利署辦理中央管流域整體改善與調適計畫執行作業要點」將生態調查作業類型分為生態固定樣站調查、生態專案調查兩類，其中生態固定樣站調查由水利規劃試驗所從本(111)年開始執行辦理，每三年一輪進行魚類、蝦蟹類和水生昆蟲等類群調查工作，期望透過定期固定樣站調查，瞭解河川生物變化趨勢與評估河川環境變化狀況，各河川局則針對轄區關注議題、關注物種另案啟動生態專案調查，以釐清生態現況及生態敏感範圍，相關生態調查方法可依操作指引辦理，以使河川情勢調查更為完備。