為解決每當颱風豪雨來臨時嘉義縣埤子頭排水系統溢淹，造成該縣六腳鄉、新港鄉及溪口鄉淹水問題，水利署(以下簡稱本署)自103年辦理流域綜合治理計畫迄今，已投入約18.8億元協助嘉義縣政府辦理該排水系統出口閘門、抽水站、滯洪池 (10.5公頃)及護岸改善工作，目前已完成出口閘門、埤子頭抽水站及銜接北港溪之護岸改善。
目前本署辦理之「前瞻基礎建設計畫-縣市管河川及區域排水整體改善計畫」補助嘉義縣政府辦理之埤子頭排水滯洪池工程(第2期)，為埤子頭排水出口最後一塊拼圖；已於本(111)年4月21日發包，工期為600日曆天，將滯洪池面積擴大為30公頃，本工程完工後即可完成埤子頭排水出口整治，將可有效防止北港溪水位高漲時造成埤子頭排水壅高溢淹；且可發揮埤子頭排水整治成效，降低周邊及上游地區之淹水風險，讓在地居民生活更有保障。