水利規劃試驗所(以下簡稱水規所）自去(111)年開始預計以兩年時間完成一輪全國24條中央管河川及2條跨縣市河川，共計250個樣站的生態固定樣站調查，以魚類、蝦蟹類和水生昆蟲類群為主要調查對象，採用電氣法、蝦籠法及定面積採集法為主要調查方法，並依棲地特性另進行一種因地制宜的調查方法，每樣站於計畫年度完成豐水期、枯水期各2次共4次調查，項目包含生物調查、環境調查、生態調查資料建置及檢核上傳，及現場調查成果統計及資料評估分析。
水規所去(111)年已進行北區、東區及南區南段共117樣站的三次調查工作，藉由統一規範率定調查方法，以及各季次調查期間辦理現地查核工作，落實調查努力量，同時建立資料標準化及資料檢核機制，以確保資料品質。
此外，水規所於2022全國河川日活動以「河川水域生態調查」為主題，進行水域生態調查工作之宣導，並以互動式體驗遊戲，讓參與的民眾更加了解維護生態環境的重要性。透過持續性定期水域生態固定樣站調查，可瞭解河川生物變化趨勢，評估河川棲地環境變化情形，使河川情勢資訊的掌握更為完備。