磺溪位於臺灣北部屬於淡水河水系，發源於大屯火山群七星山北麓流經臺北市北投區及士林區等行政區域，而後於新北市金山區入海，因地處郊區多處仍保持原始林相生態良好。自民國105年起第十河川分署依據治理計畫，逐步辦理相關整治工程，近年因生態保育意識抬頭，為減輕公共工程對生態環境造成之負面影響，並創造優質之環境，行政院公共工程委員會於民國108年5月份頒訂「公共工程生態檢核注意事項」，有助於各級政府部門辦理公共工程生態保育相關工作時能有所依循。
以111年度磺溪南勢湖二號堤防整建工程為例，於設計及施工階段辦理生態檢核作業，盤點區內重要文化、生物及植物資源，遵行迴避、縮小、減輕和補償之生態保育策略，除原有砌石堤防及灌溉水路予以保留外，對於生態保育措施上之作為有(1)迴避：既有樹群規劃保留區，並於施工過程中進行圈圍標示，樹幹部位以麻布包覆、固定，避免施工機具誤觸傷及樹木表面。(2)縮小：保留原生植物棲息地，盡量減少開挖規模。(3) 減輕：保護施工範圍內之既有植被及水域環境、設置過水便橋或就近移植原生植物。(4)補償：補償工程造成之重要生態損失，設置生物通道提供生物縱橫向連結，並廣植杜鵑復育在地花卉。
此外，本工程納入淨零碳排思維，就地取材採取河床土石構築堤身，有別於傳統鋼筋混凝土構造物增加大量碳排，同時廣植喬、灌木提高固碳量，戮力達成防洪安全兼顧生態保育多重目標，致工程得符合時代趨勢及新潮流。