為維護改善河川水體水質，並提供各界瞭解週遭水體環境現況，行政院環境保護署在重要河川皆定期進行水質監測，就懸浮固體、生化需氧量、水中溶氧量及氨氮等4項檢測結果依理化積分法估算污染長度。依據環保署110年統計，25條重要河川共2,257.8公里長度中，其中未(稍)受污染為1,481.3公里占65.6%，輕度污染236.3公里占10.5%，中度污染458.7公里占20.3%，嚴重污染82.1公里則占3.6%。若與上年比較，未(稍)受污染比率下降2.3個百分點，輕度污染比率、中度污染比率及嚴重污染比率則依序增加0.8、0.9及0.6個百分點，顯示110年重要河川污染程度較上年嚴重。
若觀察105年至110年統計資料，河川未(稍)受污染比率除106年上升至73.2%外，其餘年度約於67%上下2個百分點跳動；輕度污染比率大致呈逐年上升趨勢，110年比率為10.5%為近6年新高；中度污染比率則在16%至23%之間跳動，變動幅度較大；嚴重污染比率則在3%左右跳動，於108年下降至低點2.5%後，呈微幅上升趨勢。整體而言，河川污染程度近2年較為惡化，有待相關單位持續努力改善。