曾文溪流經臺南的人口聚集區，尤其中游緊鄰大內、山上、麻豆及善化區村落住宅區，更有高速公路、快速道路、高速鐵路等重大交通建設。為因應每逢颱風豪雨，河水挾帶的土石沉澱淤積，造成河床增高，遇洪水來臨時影響到橋梁、堤防等結構的安全。第六河川局(以下簡稱六河局)掌握非汛期期間，積極辦理曾文溪中游河段清疏，以避免大量山區坡面泥沙土石伴隨洪水淤積於河道中，導致河段束縮等情形發生。
近年度六河局特別針對曾文溪台鐵橋至麻善大橋間之易淤積河段，辦理疏濬作業，已完成約120萬立方公尺，惟為增加堤防安全性及河道通洪斷面，今（112）年將持續辦理此區段疏濬作業，規劃疏濬土方量50萬立方公尺，可大大提升通洪效率並減低汛期致災之風險。屆時可於汛期前疏通河川淤積束縮蜿蜒等急要段，達到增加通洪斷面，保障河防結構安全，確保民眾生命財產安全。