水利署負責我國多種不同水資源相關設施的建設與維護管理，其中有關污水處理廠之操作維護管理工作尤為特殊，並須做到日日不中斷、時時需警戒、刻刻不放鬆，才能確保水源水質不受污染。
臺北水源特定區管理局(以下簡稱水特局)為維護供應大臺北地區600萬人口每年8億噸用水需求的翡翠水庫水源水質，故於80年7月動工興建翡翠水庫上游污水下水道系統，其中坪林污水處理廠即為該系統中最主要的污水處理廠。坪林污水處理廠於88年9月正式運轉，成為全臺第1座設立於水源水質水量保護區內的三級污水處理廠，其位於翡翠水庫上游北勢溪與𩻸魚堀溪匯流口，設計污水處理量為3,300CMD(立方公尺/日)，主要設施包括:前處理單元(物理性)、二級處理單元(生物性)、三級處理單元(化學性)、污泥處理單元及負責全廠運作位於行政大樓的監控中心。
坪林污水廠營運迄今24年，除了不斷持續精進原有的污水處理功能，以確保河川水庫維持優良水質外，藉由用心經營與細心維護，已使污水廠蛻變成為兼具污水處理、區域防災、環境教育、生態友善、節能減碳及民眾參與的多功能永續營運場域。
(一)污水處理
建廠最久、評鑑最優。為全臺第1座設立於水源水質水量保護區內三級污水處理廠，並經內政部「101年度全國公共污水處理廠營運評鑑，核列小規模廠優等第1名」，確保翡翠水庫水質皆可維持在優良的貧養等級，且處理後放流水水質遠優於放流水標準，部分水質項目甚至達自來水水質標準。另外於111年通過ISO14001環境管理系統認證。
(二)區域防災
90年設置完成防洪牆、防洪閘門及廠內排洪井與排水管線，可避免廠區積、淹水災害；111年設置Q-water淨水設備、112年設置完成太陽能光電系統及雨水收集利用系統，可於發生災害道路中斷時，提供鄰近區域基本用水用電需求。另外，污水經三級處理後之放流水每年可回補河川流量36.5萬噸，相當於3,500人用水需求。
(三)環境教育
103年申請設置「臺北水源特定區環境教育學習中心」，並通過為環保署認證之”環境教育設施場所”，開設結合自然環境特色與相關設施介紹之系列課程，並可視機關團體或民眾本身需求選擇不同課程，以及選擇實地、線上、AR或VR參與。另外於106年獲環保署”環境教育設施場所評鑑合格及優異單位，認證為五星級環境教育學習中心”，110年則獲頒環教團隊合作精進單位。
(四)生態友善
於坪林污水廠內廣植不同層次之喬、灌木、蜜源植物及果樹，以吸引鳥類、蝶類、蜜蜂等不同生物，並配合研究需求於生態池種植當地水生植物，以提供兩棲類生物棲息空間。廠外則於北勢溪辦理「103年度北勢溪1號河溪治理工程」，結合坪林地方產業特色，採用茶葉一心二葉造型設計固床整流工，兼顧溪流生物棲地，並達到水源涵養保護及融合自然與人文景觀目標。該工程並於103年獲行政院工程會頒發金質獎優等，以及納入環境教育學習中心相關課程。經112年陸域觀察及水中攝影監測調查結果，顯示整體環境生態豐富，甚至廠區行政大樓前方即可見保育類生物藍鵲築巢棲息。
(五)節能減碳
廠區廣植喬、灌木進行固碳，年固碳量44.1噸，推動設備節電(年節電4.2萬度)及標租設置太陽能光電系統(年發電8.6萬度)進行減碳，另設置雨水貯集利用系統(年節水量1,520噸)進行沖廁或澆灌以節水，總計每年可減(固)碳120.23噸。
(六)民眾參與
110年使坪林污水廠成為百年淡蘭古道南路的中途休息站。111年則融合地方自然生態、景觀需求及環境教育功能，完成防洪牆3D立體彩繪，將其納入環教課程及成為一般民眾遊憩的打卡景點。
目前水特局正進行污水下水道系統PLC遠端即時監控及警示系統更新工作，預計今(112)年底完工後，將可於坪林污水廠即時監控3座附屬污水廠及15座抽水站運作情形，達成智慧化操作維運，未來更將以永續營運與淨零碳排為目標，積極推動廠區整體節能減碳措施及污水處理設施之延壽與適時汰換工作。