地下水補注係含水層與地下水保育最直接也最有效方法之一，由於可透過有目的之將水源補注、儲存至合適含水層，因此可藉此達到增加地下水資源量、提升地下水水位與防止海水入侵等目的。特別是由近3年經驗來看，可預期臺灣未來持續發生乾旱的頻率及風險會日益增加，因此，評估適當地點進行補注，復育並確保地下水資源量得以涵養，使能做為緊急備援堅實後盾，是必須且勢在必行。
目前水利署於有地下水補注、保育需求之彰雲及高屏地區，皆已依據中央地質調查所所公布之地下水補注地質敏感區調查成果，選定並利用濁水溪、高屏溪、荖濃溪與隘寮溪等河槽，配合定常性疏濬作業積極推動地下水補注，藉以加速相關工作推動並降低所需成本。而為能掌握地下水入滲補注水量，補注區皆有設置相關監測設備，以獲得估算水量所需相關參數，一般而言，目前採用方法有二種，其一為利用現地調查所獲得之水力傳導係數，配合不同河川水經攔蓄後產生之漫淹面積進行估算，算式如下圖1所示。
上述評估方法於國內外皆有實際操作案例驗證其可行性，雖然需要靠大量且辛苦現地觀測工作才能實現，但估算結果卻可做為相關工作規劃或調整重要參考，正所謂「積薄而為厚，聚少而為多」，若能持續進行與掌握地下水補注，則可一點一點撙節每一滴珍貴水資源，確保有限地下水得以涵養並減少抽用失衡，確保這有限地下水得以永續利用。