河川為天然形成供洪水宣洩之區域，為有效安全排洩洪水量，水利法為採取適當防洪工程，針對河川特性及流域狀況，劃定水道治理計畫線或河川區域範圍，均受水利法規範限制使用。然為顧及私有地所有權人之權益，於辦理河川治理工程時，其工程用地之取得，係依土地徵收條例相關規定辦理；另外早期既有之堤防防洪設施仍屬私有土地而未辦理徵收者，如配合防洪需要，必需改建或改善者，其工程用地依法優先辦理徵收。
依內政部「非都市土地使用管制規則」等相關規定，河川區土地容許使用除「水利」用地以外，亦涵蓋「農牧」、「交通」、「古蹟保存」、「生態保護」、「國土保安」、「特定目的事業」等7種用地得依法核准使用；另「社會救助法」第5條之2規定，未產生經濟效益之水利用地，不列入家庭不動產計算。
又為減輕土地所有權人之負擔，「水利法」第97條之1規定河川區域、區域排水等範圍內限制使用之私有土地，其使用現狀未違反本法規定者，於繼承或贈與直系血親時，免徵遺產稅、贈與稅及其土地增值稅；同法第82條第4項，河川區域內依前項致無法使用之私有土地，其位於都市計畫範圍內者，經主管機關核定實施計畫，而尚未辦理徵收前，得準用都市計畫法第83條之1第2項所定辦法有關可移出容積訂定方式、可移入容積地區範圍、接受基地可移入容積上限、移轉方式及作業方法等規定辦理容積移轉，以逐步解決河川區域內私有土地問題。