高屏溪水域生態資料，過往以水利署定期辦理之河川情勢調查報告為主要基礎資訊，較少進入蓄水範圍；為了深瞭解高屏堰上、下游蓄水範圍內，水域的生態環境及規劃未來長期的監測變動情形，南區水資源分署在去(112)年進行了高屏堰周邊水域的生態調查，系統性監測資料收集能協助維護管理機關瞭解周邊生態變動情形，做為資訊參考。為能掌握高屏堰周邊水域生態，執行高屏堰周邊魚、蝦、蟹、貝、水生昆蟲與浮游植物等調查，以建立堰壩周邊水域生態維護管理之基礎數值，做為高屏堰管理中心未來規劃相關生態監測方法之參考。
這次調查因應高屏溪溪流環境特性，運用蝦籠陷阱誘捕、手拋網法及垂釣法，總共記錄了7科12種魚類，6科6種蝦蟹螺貝類，水生昆蟲5目7科95隻，浮游植物5門26屬，浮游動物2門4種。其中，有三種魚類為臺灣特有種，分別是臺灣石魚賓、何氏棘䰾和高屏馬口鱲，在高屏堰上游樣站、和下游樣站皆有蹤跡，表示高屏堰並未對魚類造成縱向阻隔影響。
臺灣石魚賓：原本主要分布在台灣西部的溪流，但由於人為因素的影響，如今牠們已經廣泛出現在東部的溪流中。
何氏棘䰾：本來是南部和東部流域的獨特魚種，但近年來因為人為的關係，也能夠在中、北部的河川中目睹牠們的蹤影。
高屏馬口鱲：僅分布於高屏溪流域和恆春半島的溪流中，高屏堰有穩定高屏馬口鱲族群，高屏馬口鱲喜好低溫且潔淨的水域，顯示高屏堰的水質狀況良好穩定，高屏馬口鱲雄魚的頭部、腹部、胸鰭和腹鰭所展現出鮮豔迷人的黃色，更是令人嘆為觀止！
現在我們將這份豐富的調查成果與大家分享，一起關注並保護這些獨特的水域生態吧！